Κάθισε στον πάγκο της Μπάγερν ως υπηρεσιακός και ως λύση ανάγκης μετά την απόλυση του Νίκο Κόβατς, αλλά απέδειξε ότι ουδέν μονιμότερον του προσωρινού.

Ο Χανς-Ντίτερ Φλικ επανέφερε στον γερμανικό σύλλογο το πνεύμα του νικητή, ενώ επί των ημερών του οι Βαυαροί έπαιξαν ουσιαστικό, αλλά και εντυπωσιακό ποδόσφαιρο, κάτι που κεφαλαιοποιήθηκε με νέο συμβόλαιο.

Η ομάδα του Μονάχου ανακοίνωσε τη μονιμοποίηση του Φλικ στον πάγκο της πρώτης ομάδας, δείχνοντας την εμπιστοσύνη της με συμβόλαιο μέχρι το καλοκαίρι του 2023.