Στο 59′ του ημιτελικού του Nations League κόντρα στην Ελβετία, ο Πέπε είχε άσχημη πτώση και αποχώρησε τραυματίας. Η Πορτογαλία προκρίθηκε στον τελικό που θα διεξαχθεί την ερχόμενη  Κυριακή, αλλά το ιατρικό επιτελείο της πρωταθλήτριας Ευρώπης ανακοίνωσε ότι ο 36χρονος σέντερ μπακ δεν θα μπορέσει να αγωνιστεί απέναντι σε Ολλανδία ή Αγγλία που θα διεκδικήσουν σε λίγη ώρα το δεύτερο εισιτήριο για τον τελικό. 

Ο Πέπε έχει υποστεί κάταγμα στην ωμοπλάτη και κανείς δεν ξέρει ακόμα πότε θα επανέλθει. Δεν αποκλείεται να χάσει την προετοιμασία της Πόρτο ενόψει της επόμενης περιόδου.